北京2019年10月14日 /美通社/ -- 10月7日,諾貝爾委員會公布了今年首個諾貝爾獎:諾貝爾生理學或醫學獎。獎項頒發給三位科學家,以表彰他們對于細胞是怎么感知并適應氧氣變化的發現。在生物科學領域,近年來還涌現了屠呦呦等諾貝爾獲獎者,可見生物科學在推動人類發展方面的重大意義。現代生物醫學研究需建立在大量實驗樣本、生物樣本、科研中間數據的基礎之上,如何破解這些“生命科學密碼”,為生物研究提供大數據支持,成為學術界以及生物科學行業的關注點。
IT技術與生物醫學融合,曙光助力上海生科院破譯生命密碼
生物技術的發展需要信息技術提供強有力的計算工具,借助先進的IT技術解決方案,完成海量實驗數據的存儲、讀取與挖掘處理。同時,信息技術還有助于加強生物技術領域的各種數據庫管理、信息傳遞、檢索和資源共享等。
利用信息技術對生物科學數據應用領域進行深入分析,才能破譯生命密碼,近期,曙光成功中標上海生科院生物“醫學大數據設施-信息系統基礎平臺”項目,助力上海生科院在生命科學研究、生物醫藥研發、臨床醫學研究與應用的發展。
生物醫學大數據基礎設施深刻體現前沿信息技術與現代生命科學的高度交叉,采用大規模存儲為底層架構,以海量生物醫學大數據資源的高等級安全保藏為核心,實施生物醫學大數據資源的匯聚、管理、共享和挖掘,形成服務于全國的生物醫學大數據研究與應用的重大與關鍵技術條件設施。
滿足復雜運算需求,曙光ParaStor為“生物信息”提供高可靠平臺
曙光憑借多年在生物基因領域積累的經驗,打造生物基因行業云存儲解決方案,助力“生命科學”探索。曙光分布式存儲系統ParaStor更是憑借先進的應用匹配性與超高性能,贏得了市場的認可。
此次,曙光助力上海生科院生物“醫學大數據設施-信息系統基礎平臺”項目,將建設一個面向生命科學研究、生物醫藥研發、臨床醫學研究與應用,推動生物醫藥技術企業創新發展,以共享式服務為導向的科學技術綜合體。
曙光以ParaStor構建的大規模存儲系統,以海量生物醫學大數據資源的高等級安全保藏為核心,支撐高通量專業云計算服務和大數據人工智能挖掘。實現生物醫學大數據資源的匯聚、管理、共享和挖掘,成為面向全社會的生物醫學大數據標準化整合、安全管理、高效共享的存儲中心。
存儲系統作為重要的基礎架構,在本次項目中有著極為嚴苛的要求。生物醫學數據的主要類型為文本文件、圖像文件、二進制文件等非結構化數據,對存儲的要求主要在存儲容量的大小和大文件的讀寫通量的高低,而少量的關鍵數據庫、索引等結構化數據,對存儲的要求是較高 IOPS 和穩定的讀寫能力。對存儲系統的需求可總結為:業務系統存儲、高性能存儲和大容量存儲。
曙光ParaStor通過Scale-Out橫向擴展、IB+RDMA高速互聯、內核態POSIX協議、智能SSD Cache及小文件聚合等技術,消除傳統的Scale-up縱向擴展存儲架構的性能局限性,解決生物基因應用中對海量大文件存儲場景高聚合帶寬、小文件存儲場景高IOPS的存儲需求。
ParaStor分布式存儲系統可通過性能與容量的線性增長,滿足對存儲系統數據處理能力和擴展性的要求。此外,針對業務系統對可靠性、穩定性的需求,ParaStor分布式存儲系統通過多種技術手段,從物理底層到邏輯層全方位保證存儲系統高可靠性和高可用性。豐富的協議接口,多類型數據融合存儲,可以保證多業務共享。
曙光生物基因行業云存儲解決方案廣泛運用于生命科學領域,也為廣大客戶的業務提供了有效的性能保障和技術支持。在天壇醫院面向高通量基因組學數據處理與智能病理影像識別系統項目中,ParaStor通過超高吞吐性能大幅度提高了面向測序數據及影像數據科研質量、縮短科研周期、降低科研成本。與第二代基因測試儀illumina、主流應用軟件長期對接測試與優化是曙光扎根于該領域的基礎,ParaStor對于生物信息復雜應用軟件的優質適配以及均衡穩定的性能表現給某國家醫療大數據中心客戶留下了深刻的印象。