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中國首個NVIDIA Clara Parabricks基因數據分析系統交付

2021年6月9日,明碼生物科技宣布其正式啟用NVIDIA Clara Parabricks Pipeline分析軟件用于基因組應用,這是NVIDIA首次在中國交付及實施NVIDIA Clara Parabricks。

上海2021年6月10日 /美通社/ -- 2021年6月9日,明碼生物科技宣布其正式啟用NVIDIA Clara Parabricks Pipeline分析軟件用于基因組應用,這是NVIDIA首次在中國交付及實施NVIDIA Clara Parabricks。本次合作是雙方在基因測序領域進行開創型技術工作的一部分。

整套Clara Parabricks Pipeline分析軟件是一種加速計算框架,支持使用新一代測序 (NGS) 數據的人口、癌癥和 RNA 應用。Parabricks Pipelines 是建立在 NVIDIA 的 GPU 架構之上,支持一系列基因分析工具來處理從測序讀取到變異調用的NGS數據。Parabricks Pipelines 技術的引入將為明碼生物科技在測序數據分析和多組學數據分析等領域帶來顯著的性能提升。

明碼生物科技致力于應用基因技術為科研機構、制藥公司和醫療機構提供全方位的多組學研究和精準醫學應用的整體解決方案,并助力合作伙伴推動疾病發病機制的基礎研究、加速藥物研發和診斷試劑開發。同時,明碼生物科技深耕于基因大數據領域,曾參與完成了包括GMI在內的多個大型基因組項目。

“在生物信息學領域,算力和算法決定了我們對基因數據的理解能力和可獲得能力。近年來,云計算、人工智能、5G技術的快速發展為基因測序數據的存儲、共享、應用提供了更大的可能性。”明碼生物科技首席技術官李源博士表示:“明碼生物科技每日產生大量的基因測序數據,使我們極其關注生物信息學分析加速的領域,如何準確、專業、快速地處理基因大數據是明碼生物科技一直追求的課題。”

在基因3.0時代,基因大數據的有效運用將為生命科學領域帶來無限機遇,但普通實驗室計算能力已不足以應付日益龐大的數據分析,GPU計算技術的誕生不僅有助于解決數據分析瓶頸問題,更為未來包含 AI 和深度學習的實驗室數據分析提出了新的方向。NVIDIA 一直很關注健康和生命科學領域并積極布局。Parabricks是一個即用型的GPU加速軟件套件,從整個轉錄組到單細胞分析都適用于群體基因組學的DNA種系變異調用、癌癥基因組學的DNA體細胞變異調用,以及RNA測序項目。Parabricks能夠提供更好的基因組學見解并加速診斷以改善治療結果。

明碼生物科技首席信息官費家俊先生
明碼生物科技首席信息官費家俊先生

明碼生物科技首席信息官費家俊先生指出:“基因測序市場規模的擴展和大量的科研工作讓企業的IT設施受到了巨大的挑戰。而NVIDIA的出現將一定程度地緩解這些壓力,其GPU計算技術將大大加快測序數據的生物信息學分析時間,使我們能夠迅速完成客戶的計算任務,讓客戶更多地關注業務能力,發揮數據的價值。我相信,新一代互聯網技術將逐漸滲透到基因行業之中。”

NVIDIA基因合作伙伴關系全球總監George Vacek博士
NVIDIA基因合作伙伴關系全球總監George Vacek博士

NVIDIA基因合作伙伴關系全球總監George Vacek博士表示:“明碼生物科技在基因大數據領域深耕多年,我們期待與這家創新公司合作,使用NVIDIA Clara Parabricks Pipelines讓基因組醫學和數據分析造福主流醫學。”

左起:明碼生物科技首席信息官費家俊先生,NVIDIA醫療行業銷售總監趙文雄先生
左起:明碼生物科技首席信息官費家俊先生,NVIDIA醫療行業銷售總監趙文雄先生

明碼生物科技與NVIDIA的合作代表著生物技術和信息技術的融合發展,推動生命科學從“實驗驅動”向“數據驅動”轉型發展。明碼生物科技和NVIDIA 共同努力,通過強大的資源整合,為基因組學產業鋪就一條新的IT高速公路,讓未來變得更健康和美好。

消息來源:明碼(上海)生物科技有限公司
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