北京2025年8月13日 /美通社/ -- 近日,北京積算科技有限公司(以下簡稱"積算科技")推出一站式AlphaFold3在線算力服務,現已開放免費使用。其內置優化后的AlphaFold3模型,支持圖形化界面創建容器、低代碼啟動任務,通過在線服務讓科研人員繞開繁瑣的部署、設置和調試,實現零門檻使用,以更簡單、高效的方式完成蛋白質結構預測。
AlphaFold3一經發布就廣受關注,它利用Transformer、擴散模型和進化信息多序列比對,不僅能高精度預測蛋白質結構,更能預測大部分生物分子的結構及其相互作用。與傳統方法相比,在預測蛋白質與一些分子的"對接"方面精度提升高達50%,在藥物研發、疾病機理研究、精準醫學等領域應用廣泛。
AlphaFold3計算過程高度復雜,涉及大規模MSA、深度特征提取、迭代結構預測及優化,對算力平臺硬件配置要求高:GPU計算卡需要大容量顯存和高帶寬、計算節點大容量內存、數據存儲容量超700G等。同時使用門檻高,在部署和使用過程中,往往需要通過命令行直接在操作系統界面進行操作,涉及數十句代碼命令,需要操作人員具備一定的計算機編程基礎。如果通過官方網站使用AlphaFold3,則存在每個賬戶每天限額20個任務、僅夠試錯2-3個靶點、輸入長度限制等問題。
針對以上問題,積算科技在其算力服務平臺正式上線AlphaFold3應用,為用戶提供高效、易用的在線算力服務。用戶開通服務后,無需部署即可在線使用AlphaFold3的全部功能,無需排隊等待,支持最大5120AA(氨基酸,amino acid)的輸入,并具有低代碼操作、圖形化容器搭建等特點,可大幅提升用戶的使用體驗。
積算科技算力服務平臺支持圖形化界面、低代碼開發,極大地降低了使用門檻。用戶遠程登錄平臺后,通過圖形化界面快速創建容器環境,只需要通過鼠標點擊選擇預置好的鏡像、數據集及用戶自行上傳的輸入序列,30秒內便可完成預測前的所有準備。之后,用戶只需要進入容器,通過集成好的在線shell界面輸入簡單的兩句代碼,為AlphaFold3程序指定文件位置,回車運行即可體驗強大算力帶來的高水平運算速度。
支撐該算力服務平臺的算力系統以高速InfiniBand計算網絡為核心構建,配置全閃NVMe SSD共享存儲,計算節點采用64核處理器核心、1TB大容量內存、8張GPU計算卡,顯存容量超640G,為用戶帶來極高的性能體驗,加速結果生成。此外,平臺基于容器進行算力調度和資源管理,具備強大的平臺管理、用戶管理、資源管理等功能,幫助用戶快速完成蛋白質結構預測。
積算科技秉承以客戶為中心的服務理念,來自生物、醫學、材料學、計算機等不同專業領域的團隊成員緊密合作,從初期調研,到軟件安裝,再到作業測試,全程提供專業、可靠的技術解決方案。此外,積算科技撰寫了AlphaFold3使用教程,幫助用戶快速上手。
以740aa_4a5s.json為例,輸出的結果存放在用戶指定的文件夾。由于AlphaFold3并未集成結果可視化模塊,待任務完成后,客戶可將結果文件夾中的cif及json文件下載,使用pymol或paeViewer等工具進行可視化分析。
實測結果圖如下(740aa_4a5s.json):
積算科技誕生于全球生成式AI浪潮,專注于智能算力服務市場,致力于成為中國最具價值的智能算力服務商,聚焦互聯網、運營商、高校、新能源汽車等領域的多家頭部客戶提供算力服務。公司擁有萬卡級先進智能算力資源池,提供裸金屬、智能算力系統、專屬智能算力系統等算力服務產品,適用于大模型訓練與推理、算法研究、大數據分析、自動駕駛、智能科學計算等多元場景。其運維和服務團隊具備大規模智能算力系統設計建設、大模型開發應用及性能優化能力,可提供全棧大模型應用開發服務支持,并根據客戶需求提供靈活服務模式。